临床科室

• 肝病中心一科

• 肝病中心二科

• 肝病中心三科

• 肝病中心四科

• 肝病与肿瘤介入治疗中心

• 普通外科中心

• 肝病消化中心

• 重症医学科

• 综合科

• 肿瘤内科

• 感染中心门诊（性病艾滋病门诊）

• 旅行门诊

• 中西医结合中心

• 感染与免疫医学科

• 皮肤病科

• 国家药物临床试验机构

• 血液净化中心

• 泌尿外科

• HPV感染相关肛周疾病科

• 妇产科

• 五官中心

• 手术麻醉科

• 急诊科

• 远程医疗与互联网医学中心

• 呼吸与感染疾病科

• 日间手术病房

• 心血管内科

• 神经内科

• 呼吸与危重症医学科

• 儿科

医技科室

• 临床检验中心

• 放射科

• 超声与功能诊断中心

• 临床病理中心

• 图书馆

• 营养科

• 生物医学信息中心

• 科技成果转化中心

后勤科室

• 电工室

• 锅炉房

• 氧气室

• 污水处理组

• 维修组

• 环卫组

• 后勤库房

• 司机班

• 电话室

• 公寓管理办公室

• 保卫班

• 一站式后勤服务中心

• 食堂

管理科室

• 院办公室

• 党委办公室

• 团委

• 纪检办公室

• 审计处

• 离退休办公室

• 工会

• 宣传中心

• 人力资源处

• 医务处

• 护理部

• 科技处

• 教育处

• 首都医科大学传染病学系办公室

• 改革与绩效管理办公室

• 财务处

• 采购中心

• 医疗保险办公室

• 感染管理与疾病预防控制处

• 保卫处

• 总务处

• 医学工程处

• 规划建设处

• JCI评审办公室

• 疾病预防控制处

• 药学部

• 首都医科大学附属北京佑安医院伦理委员会

• 信息网络管理中心

• 门诊部

北京肝病研究所